Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HLCSP50747 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLCSP50747 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLCSP50747 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLCSP50747 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLCSP50747 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLCSP50747 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLCSP50747 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLCSP50747 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLCSP50747 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLCSP50747 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLCSP50747 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLCSP50747 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLCSP50747 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLCSP50747 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLCSP50747 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLCSP50747 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLCSP50747 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HLCSP50747 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLCSP50747 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLCSP50747 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLCSP50747 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HLCSP50747 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLCSP50747 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLCSP50747 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLCSP50747 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLCSP50747 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLCSP50747 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HLCSP50747 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLCSP50747 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLCSP50747 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLCSP50747 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HLCSP50747 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLCSP50747 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HLCSP50747 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLCSP50747 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLCSP50747 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLCSP50747 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLCSP50747 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLCSP50747 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLCSP50747 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLCSP50747 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLCSP50747 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLCSP50747 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLCSP50747 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLCSP50747 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLCSP50747 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLCSP50747 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLCSP50747 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLCSP50747 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLCSP50747 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLCSP50747 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLCSP50747 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLCSP50747 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLCSP50747 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLCSP50747 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLCSP50747 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLCSP50747 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLCSP50747 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLCSP50747 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLCSP50747 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLCSP50747 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLCSP50747 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLCSP50747 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLCSP50747 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLCSP50747 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLCSP50747 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLCSP50747 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLCSP50747 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLCSP50747 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLCSP50747 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLCSP50747 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLCSP50747 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLCSP50747 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLCSP50747 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLCSP50747 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLCSP50747 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLCSP50747 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLCSP50747 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLCSP50747 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLCSP50747 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLCSP50747 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLCSP50747 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLCSP50747 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLCSP50747 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLCSP50747 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLCSP50747 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLCSP50747 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLCSP50747 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HLCSP50747 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLCSP50747 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLCSP50747 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLCSP50747 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLCSP50747 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLCSP50747 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLCSP50747 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLCSP50747 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLCSP50747 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLCSP50747 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLCSP50747 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms