Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMDP50402 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMDP50402 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMDP50402 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMDP50402 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMDP50402 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMDP50402 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMDP50402 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMDP50402 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMDP50402 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMDP50402 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMDP50402 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMDP50402 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMDP50402 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMDP50402 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMDP50402 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMDP50402 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMDP50402 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMDP50402 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMDP50402 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMDP50402 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMDP50402 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMDP50402 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMDP50402 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMDP50402 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMDP50402 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EMDP50402 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMDP50402 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMDP50402 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMDP50402 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMDP50402 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMDP50402 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMDP50402 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMDP50402 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMDP50402 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMDP50402 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMDP50402 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMDP50402 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EMDP50402 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMDP50402 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMDP50402 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMDP50402 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMDP50402 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMDP50402 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMDP50402 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMDP50402 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMDP50402 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMDP50402 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMDP50402 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMDP50402 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMDP50402 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMDP50402 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMDP50402 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMDP50402 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMDP50402 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMDP50402 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMDP50402 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMDP50402 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMDP50402 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMDP50402 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMDP50402 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMDP50402 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMDP50402 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EMDP50402 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMDP50402 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMDP50402 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMDP50402 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMDP50402 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EMDP50402 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMDP50402 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMDP50402 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMDP50402 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EMDP50402 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMDP50402 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMDP50402 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMDP50402 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMDP50402 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMDP50402 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMDP50402 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMDP50402 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMDP50402 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMDP50402 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMDP50402 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMDP50402 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMDP50402 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMDP50402 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMDP50402 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMDP50402 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMDP50402 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMDP50402 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMDP50402 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMDP50402 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMDP50402 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMDP50402 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EMDP50402 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMDP50402 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMDP50402 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMDP50402 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMDP50402 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMDP50402 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms