Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP4P49662 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP4P49662 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP4P49662 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP4P49662 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP4P49662 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP4P49662 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP4P49662 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP4P49662 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP4P49662 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP4P49662 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP4P49662 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP4P49662 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP4P49662 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP4P49662 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP4P49662 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP4P49662 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP4P49662 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP4P49662 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP4P49662 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP4P49662 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP4P49662 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP4P49662 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP4P49662 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP4P49662 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP4P49662 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP4P49662 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP4P49662 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP4P49662 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP4P49662 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP4P49662 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP4P49662 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP4P49662 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP4P49662 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP4P49662 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP4P49662 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP4P49662 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP4P49662 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP4P49662 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP4P49662 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP4P49662 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP4P49662 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP4P49662 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP4P49662 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP4P49662 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP4P49662 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP4P49662 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP4P49662 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP4P49662 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP4P49662 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP4P49662 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP4P49662 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP4P49662 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP4P49662 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP4P49662 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP4P49662 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP4P49662 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP4P49662 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP4P49662 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP4P49662 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP4P49662 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP4P49662 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASP4P49662 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASP4P49662 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP4P49662 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP4P49662 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP4P49662 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP4P49662 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP4P49662 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP4P49662 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP4P49662 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP4P49662 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP4P49662 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP4P49662 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP4P49662 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP4P49662 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP4P49662 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP4P49662 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP4P49662 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP4P49662 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP4P49662 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP4P49662 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP4P49662 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP4P49662 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP4P49662 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP4P49662 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP4P49662 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms