Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMAN1P49257 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMAN1P49257 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms