Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLMP48507 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLMP48507 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCLMP48507 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCLMP48507 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCLMP48507 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLMP48507 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLMP48507 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLMP48507 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLMP48507 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLMP48507 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLMP48507 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLMP48507 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLMP48507 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLMP48507 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLMP48507 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLMP48507 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLMP48507 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLMP48507 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLMP48507 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLMP48507 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLMP48507 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLMP48507 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLMP48507 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLMP48507 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLMP48507 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLMP48507 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLMP48507 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLMP48507 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCLMP48507 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GCLMP48507 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GCLMP48507 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLMP48507 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLMP48507 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLMP48507 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLMP48507 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLMP48507 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLMP48507 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLMP48507 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLMP48507 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLMP48507 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLMP48507 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLMP48507 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLMP48507 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCLMP48507 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCLMP48507 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCLMP48507 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCLMP48507 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCLMP48507 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLMP48507 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLMP48507 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLMP48507 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLMP48507 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLMP48507 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLMP48507 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCLMP48507 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCLMP48507 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GCLMP48507 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCLMP48507 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLMP48507 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLMP48507 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLMP48507 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLMP48507 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLMP48507 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLMP48507 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLMP48507 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLMP48507 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLMP48507 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLMP48507 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLMP48507 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLMP48507 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLMP48507 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLMP48507 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCLMP48507 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCLMP48507 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCLMP48507 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCLMP48507 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCLMP48507 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLMP48507 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLMP48507 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCLMP48507 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCLMP48507 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLMP48507 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLMP48507 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLMP48507 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLMP48507 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLMP48507 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLMP48507 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLMP48507 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLMP48507 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLMP48507 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms