Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PIP4K2AP48426 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PIP4K2AP48426 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PIP4K2AP48426 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PIP4K2AP48426 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PIP4K2AP48426 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms