Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRCC3P46736 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRCC3P46736 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCC3P46736 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms