Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD52P43351 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD52P43351 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD52P43351 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD52P43351 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD52P43351 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD52P43351 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD52P43351 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD52P43351 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD52P43351 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD52P43351 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD52P43351 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD52P43351 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD52P43351 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD52P43351 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD52P43351 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD52P43351 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD52P43351 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD52P43351 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD52P43351 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD52P43351 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD52P43351 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD52P43351 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD52P43351 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD52P43351 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD52P43351 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD52P43351 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD52P43351 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD52P43351 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD52P43351 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD52P43351 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD52P43351 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD52P43351 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD52P43351 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD52P43351 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD52P43351 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD52P43351 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD52P43351 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD52P43351 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD52P43351 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD52P43351 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAD52P43351 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD52P43351 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD52P43351 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD52P43351 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD52P43351 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD52P43351 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD52P43351 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD52P43351 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD52P43351 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD52P43351 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD52P43351 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD52P43351 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD52P43351 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD52P43351 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD52P43351 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD52P43351 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD52P43351 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD52P43351 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD52P43351 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD52P43351 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD52P43351 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD52P43351 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD52P43351 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD52P43351 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD52P43351 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD52P43351 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD52P43351 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD52P43351 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD52P43351 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD52P43351 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD52P43351 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD52P43351 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD52P43351 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD52P43351 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD52P43351 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD52P43351 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD52P43351 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD52P43351 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms