Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR2P43308 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR2P43308 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR2P43308 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR2P43308 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSR2P43308 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR2P43308 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR2P43308 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR2P43308 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSR2P43308 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSR2P43308 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSR2P43308 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSR2P43308 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR2P43308 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR2P43308 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR2P43308 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR2P43308 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR2P43308 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR2P43308 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR2P43308 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR2P43308 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR2P43308 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR2P43308 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR2P43308 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR2P43308 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR2P43308 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR2P43308 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR2P43308 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SSR2P43308 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR2P43308 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR2P43308 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR2P43308 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR2P43308 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR2P43308 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR2P43308 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR2P43308 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR2P43308 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR2P43308 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR2P43308 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR2P43308 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR2P43308 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR2P43308 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR2P43308 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR2P43308 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR2P43308 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR2P43308 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR2P43308 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSR2P43308 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR2P43308 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSR2P43308 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR2P43308 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR2P43308 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR2P43308 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSR2P43308 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR2P43308 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR2P43308 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSR2P43308 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSR2P43308 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSR2P43308 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR2P43308 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR2P43308 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR2P43308 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR2P43308 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR2P43308 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR2P43308 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR2P43308 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR2P43308 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR2P43308 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR2P43308 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR2P43308 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR2P43308 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR2P43308 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR2P43308 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR2P43308 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR2P43308 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms