Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF5P43026 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF5P43026 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF5P43026 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF5P43026 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF5P43026 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF5P43026 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF5P43026 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF5P43026 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF5P43026 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF5P43026 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF5P43026 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF5P43026 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF5P43026 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF5P43026 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF5P43026 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF5P43026 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF5P43026 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF5P43026 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF5P43026 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF5P43026 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF5P43026 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF5P43026 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF5P43026 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF5P43026 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF5P43026 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF5P43026 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF5P43026 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF5P43026 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF5P43026 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF5P43026 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF5P43026 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF5P43026 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF5P43026 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF5P43026 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF5P43026 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF5P43026 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF5P43026 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF5P43026 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF5P43026 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF5P43026 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF5P43026 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF5P43026 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF5P43026 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF5P43026 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF5P43026 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF5P43026 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF5P43026 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF5P43026 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF5P43026 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF5P43026 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF5P43026 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF5P43026 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF5P43026 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF5P43026 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF5P43026 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF5P43026 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF5P43026 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF5P43026 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF5P43026 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF5P43026 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF5P43026 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF5P43026 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF5P43026 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF5P43026 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF5P43026 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF5P43026 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF5P43026 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF5P43026 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF5P43026 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF5P43026 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF5P43026 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF5P43026 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF5P43026 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF5P43026 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF5P43026 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF5P43026 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF5P43026 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF5P43026 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF5P43026 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDF5P43026 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF5P43026 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF5P43026 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF5P43026 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF5P43026 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF5P43026 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF5P43026 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF5P43026 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF5P43026 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF5P43026 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF5P43026 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms