Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A2P43004 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A2P43004 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A2P43004 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms