Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 PPA2YMR267W 933 nt7.19□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 LSP1YPL004C 1026 nt7.19□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 PAF1YBR279W 1338 nt7.19□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YBL113CYBL113C 2379 nt7.18□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 DST1YGL043W 930 nt7.18□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 CBT1YKL208W 816 nt7.18□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt7.18□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YPL108WYPL108W 507 nt7.18□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 PRM4YPL156C 855 nt7.18□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 HTS1YPR033C 1641 nt7.18□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 CLD1YGR110W 1338 nt7.18□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 ARG7YMR062C 1326 nt7.18□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 SAM50YNL026W 1455 nt7.17□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 MCM21YDR318W 1107 nt7.17□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YIR043CYIR043C 693 nt7.17□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 ERV41YML067C 1059 nt7.17□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YOR041CYOR041C 432 nt7.17□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 MNN9YPL050C 1188 nt7.17□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 JHD1YER051W 1479 nt7.17□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 BUD9YGR041W 1644 nt7.16□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt7.16□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YNL303WYNL303W 348 nt7.16□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YOR300WYOR300W 309 nt7.16□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YKR018CYKR018C 2178 nt7.16□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 CTF18YMR078C 2226 nt7.16□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 POB3YML069W 1659 nt7.16□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 IPI3YNL182C 1668 nt7.16□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 AQR1YNL065W 1761 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YER138W-AYER138W-A 105 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YGR011WYGR011W 327 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 PMU1YKL128C 888 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 PET10YKR046C 852 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 VPS65YLR322W 315 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 TIP41YPR040W 1071 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 TFB4YPR056W 1017 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 snR189snR189 189 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 NMT1YLR195C 1368 nt7.15□□□□□ -1.26
YAR028WP39548 CDC16YKL022C 2523 nt7.15□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 GGC1YDL198C 903 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 RPL12BYDR418W 498 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 BUD16YEL029C 939 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 HAT2YEL056W 1206 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 YHR033WYHR033W 1272 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 YHC3YJL059W 1227 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 NAP1YKR048C 1254 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 DCR2YLR361C 1737 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 BAG7YOR134W 1230 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 OSW1YOR255W 837 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 RAD17YOR368W 1206 nt7.14□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 SNU66YOR308C 1764 nt7.13□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 SPO77YLR341W 1434 nt7.13□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 OKP1YGR179C 1221 nt7.13□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 YJL043WYJL043W 774 nt7.13□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 BXI1YNL305C 894 nt7.13□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 FRT1YOR324C 1809 nt7.13□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 ADE2YOR128C 1716 nt7.13□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 MGR3YMR115W 1506 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 TCB1YOR086C 3561 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 YDR161WYDR161W 1164 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 LSM6YDR378C 261 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 YER137CYER137C 447 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 YHL044WYHL044W 708 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 CPR2YHR057C 618 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 XPT1YJR133W 630 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 RER1YCL001W 567 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 CDC23YHR166C 1881 nt7.12□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 PRB1YEL060C 1908 nt7.11□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 TPI1YDR050C 747 nt7.11□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 GTS1YGL181W 1191 nt7.11□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 HNM1YGL077C 1692 nt7.1□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 YDR215CYDR215C 414 nt7.1□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 SHO1YER118C 1104 nt7.1□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 MSP1YGR028W 1089 nt7.1□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 GTO1YGR154C 1071 nt7.1□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 ERV25YML012W 636 nt7.1□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 YGP1YNL160W 1065 nt7.1□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 SEC24YIL109C 2781 nt7.1□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 SPC42YKL042W 1092 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 CAR2YLR438W 1275 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 PFA4YOL003C 1137 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 DCP1YOL149W 696 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 OAZ1YPL052W 879 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 RPS6AYPL090C 711 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 RTC2YBR147W 891 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 RPS6BYBR181C 711 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 SAL1YNL083W 1485 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 ECM27YJR106W 2178 nt7.09□□□□□ -1.27
YAR028WP39548 CKI1YLR133W 1749 nt7.08□□□□□ -1.28
YAR028WP39548 CNM67YNL225C 1746 nt7.08□□□□□ -1.28
YAR028WP39548 TCA17YEL048C 459 nt7.08□□□□□ -1.28
YAR028WP39548 YER156CYER156C 1017 nt7.08□□□□□ -1.28
YAR028WP39548 YNL017CYNL017C 339 nt7.08□□□□□ -1.28
YAR028WP39548 BTS1YPL069C 1008 nt7.08□□□□□ -1.28
YAR028WP39548 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36 ms