Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM23P36406 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM23P36406 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM23P36406 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms