Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF2P35227 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCGF2P35227 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF2P35227 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF2P35227 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms