Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC1P35052 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC1P35052 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC1P35052 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC1P35052 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC1P35052 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC1P35052 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC1P35052 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC1P35052 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC1P35052 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC1P35052 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC1P35052 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC1P35052 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC1P35052 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC1P35052 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC1P35052 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC1P35052 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC1P35052 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC1P35052 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC1P35052 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC1P35052 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC1P35052 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC1P35052 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC1P35052 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC1P35052 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC1P35052 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC1P35052 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC1P35052 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC1P35052 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC1P35052 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC1P35052 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC1P35052 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC1P35052 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC1P35052 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC1P35052 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC1P35052 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC1P35052 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC1P35052 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC1P35052 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC1P35052 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC1P35052 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC1P35052 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC1P35052 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC1P35052 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC1P35052 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC1P35052 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC1P35052 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC1P35052 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC1P35052 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC1P35052 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC1P35052 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC1P35052 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC1P35052 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC1P35052 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC1P35052 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC1P35052 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC1P35052 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC1P35052 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC1P35052 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC1P35052 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC1P35052 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC1P35052 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC1P35052 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC1P35052 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC1P35052 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC1P35052 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC1P35052 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC1P35052 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC1P35052 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC1P35052 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC1P35052 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC1P35052 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC1P35052 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC1P35052 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC1P35052 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC1P35052 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC1P35052 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC1P35052 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC1P35052 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC1P35052 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC1P35052 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC1P35052 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC1P35052 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC1P35052 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC1P35052 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC1P35052 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC1P35052 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC1P35052 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC1P35052 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC1P35052 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC1P35052 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC1P35052 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC1P35052 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC1P35052 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC1P35052 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC1P35052 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC1P35052 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC1P35052 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC1P35052 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC1P35052 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms