Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC25CP30307 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC25CP30307 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC25CP30307 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC25CP30307 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC25CP30307 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC25CP30307 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms