Protein–RNA interactions for Protein: P24298

GPT, Alanine aminotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPTP24298 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GPTP24298 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GPTP24298 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GPTP24298 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GPTP24298 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GPTP24298 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GPTP24298 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GPTP24298 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GPTP24298 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GPTP24298 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GPTP24298 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GPTP24298 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GPTP24298 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GPTP24298 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GPTP24298 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GPTP24298 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GPTP24298 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GPTP24298 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
GPTP24298 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GPTP24298 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GPTP24298 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GPTP24298 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GPTP24298 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GPTP24298 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GPTP24298 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GPTP24298 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GPTP24298 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GPTP24298 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GPTP24298 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPTP24298 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPTP24298 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPTP24298 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPTP24298 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPTP24298 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPTP24298 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPTP24298 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPTP24298 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GPTP24298 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GPTP24298 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GPTP24298 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GPTP24298 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GPTP24298 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GPTP24298 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GPTP24298 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GPTP24298 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GPTP24298 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GPTP24298 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
GPTP24298 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GPTP24298 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GPTP24298 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GPTP24298 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GPTP24298 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GPTP24298 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GPTP24298 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GPTP24298 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GPTP24298 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GPTP24298 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GPTP24298 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GPTP24298 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
GPTP24298 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GPTP24298 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GPTP24298 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GPTP24298 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GPTP24298 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GPTP24298 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GPTP24298 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GPTP24298 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GPTP24298 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GPTP24298 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GPTP24298 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GPTP24298 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GPTP24298 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GPTP24298 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GPTP24298 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GPTP24298 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GPTP24298 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GPTP24298 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GPTP24298 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GPTP24298 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GPTP24298 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GPTP24298 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GPTP24298 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GPTP24298 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GPTP24298 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GPTP24298 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GPTP24298 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GPTP24298 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GPTP24298 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GPTP24298 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GPTP24298 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GPTP24298 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GPTP24298 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GPTP24298 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GPTP24298 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GPTP24298 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GPTP24298 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GPTP24298 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GPTP24298 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GPTP24298 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GPTP24298 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms