Protein–RNA interactions for Protein: P19454

CKA2, Casein kinase II subunit alpha', yeastyeast

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CKA2P19454 YOR111WYOR111W 699 nt7.51□□□□□ -1.21
CKA2P19454 ASR1YPR093C 867 nt7.51□□□□□ -1.21
CKA2P19454 MSC3YLR219W 2187 nt7.51□□□□□ -1.21
CKA2P19454 NUP49YGL172W 1419 nt7.51□□□□□ -1.21
CKA2P19454 BNA3YJL060W 1335 nt7.51□□□□□ -1.21
CKA2P19454 SPG5YMR191W 1122 nt7.5□□□□□ -1.21
CKA2P19454 YOR012WYOR012W 414 nt7.5□□□□□ -1.21
CKA2P19454 AMN1YBR158W 1650 nt7.5□□□□□ -1.21
CKA2P19454 TUF1YOR187W 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
CKA2P19454 FMP40YPL222W 2067 nt7.49□□□□□ -1.21
CKA2P19454 MRPS28YDR337W 861 nt7.49□□□□□ -1.21
CKA2P19454 MRPL28YDR462W 444 nt7.49□□□□□ -1.21
CKA2P19454 MTR3YGR158C 753 nt7.49□□□□□ -1.21
CKA2P19454 AFG2YLR397C 2343 nt7.49□□□□□ -1.21
CKA2P19454 ECM27YJR106W 2178 nt7.48□□□□□ -1.21
CKA2P19454 RFS1YBR052C 633 nt7.48□□□□□ -1.21
CKA2P19454 AQR1YNL065W 1761 nt7.47□□□□□ -1.21
CKA2P19454 URH1YDR400W 1023 nt7.47□□□□□ -1.21
CKA2P19454 CBR1YIL043C 855 nt7.47□□□□□ -1.21
CKA2P19454 CMK2YOL016C 1344 nt7.47□□□□□ -1.21
CKA2P19454 FCP1YMR277W 2199 nt7.46□□□□□ -1.21
CKA2P19454 HED1YDR014W-A 489 nt7.46□□□□□ -1.22
CKA2P19454 RPL2BYIL018W 765 nt7.46□□□□□ -1.22
CKA2P19454 YMR034CYMR034C 1305 nt7.46□□□□□ -1.22
CKA2P19454 SEC62YPL094C 825 nt7.45□□□□□ -1.22
CKA2P19454 YIL108WYIL108W 2091 nt7.45□□□□□ -1.22
CKA2P19454 HEL1YKR017C 1656 nt7.44□□□□□ -1.22
CKA2P19454 CRH1YGR189C 1524 nt7.43□□□□□ -1.22
CKA2P19454 ERS1YCR075C 783 nt7.43□□□□□ -1.22
CKA2P19454 LCL3YGL085W 825 nt7.43□□□□□ -1.22
CKA2P19454 ARC35YNR035C 1029 nt7.43□□□□□ -1.22
CKA2P19454 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.42□□□□□ -1.22
CKA2P19454 YDL177CYDL177C 513 nt7.41□□□□□ -1.22
CKA2P19454 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.41□□□□□ -1.22
CKA2P19454 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.41□□□□□ -1.22
CKA2P19454 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.41□□□□□ -1.22
CKA2P19454 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.41□□□□□ -1.22
CKA2P19454 TMA46YOR091W 1038 nt7.41□□□□□ -1.22
CKA2P19454 LSC1YOR142W 990 nt7.41□□□□□ -1.22
CKA2P19454 MCH2YKL221W 1422 nt7.41□□□□□ -1.22
CKA2P19454 PAC2YER007W 1557 nt7.41□□□□□ -1.22
CKA2P19454 YKL102CYKL102C 306 nt7.4□□□□□ -1.22
CKA2P19454 SWD1YAR003W 1281 nt7.4□□□□□ -1.22
CKA2P19454 YNL092WYNL092W 1203 nt7.4□□□□□ -1.22
CKA2P19454 YNL040WYNL040W 1371 nt7.4□□□□□ -1.22
CKA2P19454 MSB3YNL293W 1902 nt7.4□□□□□ -1.23
CKA2P19454 YCR061WYCR061W 1896 nt7.39□□□□□ -1.23
CKA2P19454 YBR241CYBR241C 1467 nt7.39□□□□□ -1.23
CKA2P19454 PAC10YGR078C 600 nt7.39□□□□□ -1.23
CKA2P19454 ASF1YJL115W 840 nt7.39□□□□□ -1.23
CKA2P19454 PPM2YOL141W 2088 nt7.39□□□□□ -1.23
CKA2P19454 TRS31YDR472W 852 nt7.38□□□□□ -1.23
CKA2P19454 TAF9YMR236W 474 nt7.38□□□□□ -1.23
CKA2P19454 ATO2YNR002C 849 nt7.38□□□□□ -1.23
CKA2P19454 NUP84YDL116W 2181 nt7.37□□□□□ -1.23
CKA2P19454 YSC83YHR017W 1158 nt7.37□□□□□ -1.23
CKA2P19454 ATG36YJL185C 882 nt7.37□□□□□ -1.23
CKA2P19454 ILV6YCL009C 930 nt7.37□□□□□ -1.23
CKA2P19454 DOT1YDR440W 1749 nt7.37□□□□□ -1.23
CKA2P19454 YHR020WYHR020W 2067 nt7.37□□□□□ -1.23
CKA2P19454 SAL1YNL083W 1485 nt7.36□□□□□ -1.23
CKA2P19454 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.36□□□□□ -1.23
CKA2P19454 RNH1YMR234W 1047 nt7.36□□□□□ -1.23
CKA2P19454 MRPS18YNL306W 654 nt7.36□□□□□ -1.23
CKA2P19454 HBN1YCL026C-B 582 nt7.36□□□□□ -1.23
CKA2P19454 IMG1YCR046C 510 nt7.35□□□□□ -1.23
CKA2P19454 FMO1YHR176W 1299 nt7.35□□□□□ -1.23
CKA2P19454 HHY1YEL059W 309 nt7.34□□□□□ -1.23
CKA2P19454 YBR113WYBR113W 483 nt7.34□□□□□ -1.23
CKA2P19454 RGD2YFL047W 2145 nt7.34□□□□□ -1.23
CKA2P19454 CYB2YML054C 1776 nt7.33□□□□□ -1.24
CKA2P19454 HXT13YEL069C 1695 nt7.33□□□□□ -1.24
CKA2P19454 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.33□□□□□ -1.24
CKA2P19454 AIM20YIL158W 615 nt7.33□□□□□ -1.24
CKA2P19454 YKL077WYKL077W 1179 nt7.33□□□□□ -1.24
CKA2P19454 SRY1YKL218C 981 nt7.33□□□□□ -1.24
CKA2P19454 COQ1YBR003W 1422 nt7.32□□□□□ -1.24
CKA2P19454 TAH11YJR046W 1815 nt7.31□□□□□ -1.24
CKA2P19454 GCG1YER163C 699 nt7.31□□□□□ -1.24
CKA2P19454 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.31□□□□□ -1.24
CKA2P19454 YRB2YIL063C 984 nt7.31□□□□□ -1.24
CKA2P19454 IRC11YOR013W 471 nt7.31□□□□□ -1.24
CKA2P19454 YHK8YHR048W 1545 nt7.31□□□□□ -1.24
CKA2P19454 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.3□□□□□ -1.24
CKA2P19454 YAR064WYAR064W 300 nt7.3□□□□□ -1.24
CKA2P19454 MRPL23YOR150W 492 nt7.3□□□□□ -1.24
CKA2P19454 PRY3YJL078C 2646 nt7.3□□□□□ -1.24
CKA2P19454 COX10YPL172C 1389 nt7.29□□□□□ -1.24
CKA2P19454 CCT3YJL014W 1605 nt7.28□□□□□ -1.24
CKA2P19454 NTG1YAL015C 1200 nt7.28□□□□□ -1.24
CKA2P19454 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.27□□□□□ -1.25
CKA2P19454 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.27□□□□□ -1.25
CKA2P19454 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.27□□□□□ -1.25
CKA2P19454 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.27□□□□□ -1.25
CKA2P19454 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.27□□□□□ -1.25
CKA2P19454 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.27□□□□□ -1.25
CKA2P19454 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.27□□□□□ -1.25
CKA2P19454 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.27□□□□□ -1.25
CKA2P19454 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.27□□□□□ -1.25
CKA2P19454 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms