Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD53P19397 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD53P19397 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD53P19397 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD53P19397 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD53P19397 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD53P19397 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD53P19397 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD53P19397 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD53P19397 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD53P19397 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD53P19397 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD53P19397 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD53P19397 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD53P19397 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD53P19397 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD53P19397 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD53P19397 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD53P19397 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD53P19397 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD53P19397 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD53P19397 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD53P19397 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD53P19397 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD53P19397 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD53P19397 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD53P19397 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD53P19397 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD53P19397 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD53P19397 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD53P19397 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD53P19397 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD53P19397 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD53P19397 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD53P19397 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD53P19397 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD53P19397 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD53P19397 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD53P19397 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD53P19397 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD53P19397 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD53P19397 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD53P19397 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD53P19397 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD53P19397 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD53P19397 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD53P19397 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD53P19397 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD53P19397 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD53P19397 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD53P19397 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD53P19397 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD53P19397 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD53P19397 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD53P19397 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD53P19397 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD53P19397 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD53P19397 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD53P19397 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD53P19397 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD53P19397 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD53P19397 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD53P19397 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD53P19397 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD53P19397 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD53P19397 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD53P19397 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD53P19397 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD53P19397 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD53P19397 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD53P19397 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD53P19397 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD53P19397 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD53P19397 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD53P19397 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD53P19397 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD53P19397 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD53P19397 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD53P19397 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD53P19397 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD53P19397 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD53P19397 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD53P19397 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD53P19397 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD53P19397 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD53P19397 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD53P19397 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD53P19397 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms