Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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