Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTLA4P16410 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTLA4P16410 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTLA4P16410 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms