Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT5P13647 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT5P13647 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT5P13647 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT5P13647 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT5P13647 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT5P13647 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT5P13647 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT5P13647 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT5P13647 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT5P13647 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT5P13647 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT5P13647 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT5P13647 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT5P13647 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT5P13647 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT5P13647 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT5P13647 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT5P13647 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT5P13647 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT5P13647 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT5P13647 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT5P13647 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT5P13647 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT5P13647 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT5P13647 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT5P13647 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT5P13647 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT5P13647 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT5P13647 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT5P13647 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT5P13647 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT5P13647 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT5P13647 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT5P13647 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT5P13647 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT5P13647 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT5P13647 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT5P13647 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT5P13647 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT5P13647 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT5P13647 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT5P13647 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT5P13647 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT5P13647 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT5P13647 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT5P13647 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT5P13647 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT5P13647 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT5P13647 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT5P13647 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT5P13647 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT5P13647 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT5P13647 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT5P13647 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT5P13647 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT5P13647 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT5P13647 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT5P13647 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT5P13647 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT5P13647 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT5P13647 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT5P13647 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT5P13647 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT5P13647 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT5P13647 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT5P13647 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT5P13647 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT5P13647 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT5P13647 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT5P13647 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT5P13647 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT5P13647 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT5P13647 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT5P13647 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT5P13647 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT5P13647 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT5P13647 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT5P13647 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT5P13647 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT5P13647 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT5P13647 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT5P13647 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT5P13647 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT5P13647 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT5P13647 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT5P13647 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT5P13647 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT5P13647 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT5P13647 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT5P13647 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT5P13647 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT5P13647 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT5P13647 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT5P13647 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT5P13647 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT5P13647 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT5P13647 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT5P13647 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT5P13647 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms