Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT10P13645 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT10P13645 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT10P13645 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT10P13645 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT10P13645 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT10P13645 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT10P13645 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT10P13645 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT10P13645 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT10P13645 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT10P13645 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT10P13645 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT10P13645 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT10P13645 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT10P13645 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT10P13645 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT10P13645 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT10P13645 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT10P13645 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT10P13645 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT10P13645 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT10P13645 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT10P13645 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT10P13645 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT10P13645 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT10P13645 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT10P13645 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT10P13645 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT10P13645 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT10P13645 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT10P13645 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT10P13645 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT10P13645 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT10P13645 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT10P13645 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT10P13645 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT10P13645 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT10P13645 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT10P13645 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT10P13645 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT10P13645 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT10P13645 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT10P13645 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT10P13645 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT10P13645 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT10P13645 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT10P13645 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT10P13645 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT10P13645 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT10P13645 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT10P13645 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT10P13645 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT10P13645 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT10P13645 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT10P13645 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT10P13645 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT10P13645 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT10P13645 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT10P13645 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT10P13645 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT10P13645 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT10P13645 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT10P13645 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT10P13645 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT10P13645 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT10P13645 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT10P13645 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT10P13645 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT10P13645 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT10P13645 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT10P13645 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT10P13645 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT10P13645 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT10P13645 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT10P13645 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT10P13645 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT10P13645 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms