Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCL5P13501 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL5P13501 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL5P13501 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL5P13501 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL5P13501 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL5P13501 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL5P13501 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL5P13501 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL5P13501 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL5P13501 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL5P13501 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL5P13501 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL5P13501 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL5P13501 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCL5P13501 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCL5P13501 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCL5P13501 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCL5P13501 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL5P13501 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL5P13501 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCL5P13501 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCL5P13501 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL5P13501 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL5P13501 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL5P13501 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL5P13501 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL5P13501 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL5P13501 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCL5P13501 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCL5P13501 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCL5P13501 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCL5P13501 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCL5P13501 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL5P13501 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL5P13501 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL5P13501 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL5P13501 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCL5P13501 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCL5P13501 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCL5P13501 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCL5P13501 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCL5P13501 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCL5P13501 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCL5P13501 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL5P13501 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL5P13501 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL5P13501 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL5P13501 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCL5P13501 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCL5P13501 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCL5P13501 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCL5P13501 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCL5P13501 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCL5P13501 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCL5P13501 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCL5P13501 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCL5P13501 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCL5P13501 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCL5P13501 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCL5P13501 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCL5P13501 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCL5P13501 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCL5P13501 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCL5P13501 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCL5P13501 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL5P13501 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL5P13501 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL5P13501 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCL5P13501 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCL5P13501 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCL5P13501 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCL5P13501 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCL5P13501 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCL5P13501 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCL5P13501 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCL5P13501 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCL5P13501 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCL5P13501 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCL5P13501 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCL5P13501 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL5P13501 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL5P13501 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCL5P13501 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCL5P13501 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCL5P13501 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCL5P13501 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCL5P13501 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCL5P13501 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCL5P13501 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCL5P13501 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCL5P13501 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCL5P13501 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCL5P13501 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCL5P13501 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCL5P13501 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCL5P13501 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCL5P13501 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCL5P13501 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCL5P13501 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms