Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GP1BBP13224 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GP1BBP13224 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GP1BBP13224 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP1BBP13224 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms