Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBP11277 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBP11277 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBP11277 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBP11277 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBP11277 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBP11277 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBP11277 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBP11277 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBP11277 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBP11277 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBP11277 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTBP11277 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTBP11277 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTBP11277 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTBP11277 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTBP11277 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTBP11277 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTBP11277 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTBP11277 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTBP11277 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBP11277 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBP11277 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBP11277 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBP11277 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBP11277 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBP11277 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBP11277 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBP11277 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBP11277 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBP11277 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBP11277 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBP11277 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBP11277 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBP11277 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBP11277 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBP11277 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBP11277 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBP11277 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBP11277 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBP11277 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBP11277 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBP11277 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBP11277 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTBP11277 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTBP11277 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTBP11277 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBP11277 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBP11277 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBP11277 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBP11277 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBP11277 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBP11277 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBP11277 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBP11277 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBP11277 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBP11277 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBP11277 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBP11277 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBP11277 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBP11277 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBP11277 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBP11277 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBP11277 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBP11277 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBP11277 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBP11277 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBP11277 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBP11277 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBP11277 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBP11277 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBP11277 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBP11277 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
SPTBP11277 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBP11277 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBP11277 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBP11277 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBP11277 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBP11277 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBP11277 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBP11277 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms