Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD3P0DMS9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD3P0DMS9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD3P0DMS9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms