Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPIPA8P0DM63 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPIPA8P0DM63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA8P0DM63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPA8P0DM63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPA8P0DM63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms