Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PATE4P0C8F1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PATE4P0C8F1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PATE4P0C8F1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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