Protein–RNA interactions for Protein: P0C7U9

FAM87A, Protein FAM87A, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM87AP0C7U9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM87AP0C7U9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM87AP0C7U9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM87AP0C7U9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM87AP0C7U9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms