Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3P09919 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3P09919 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF3P09919 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF3P09919 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF3P09919 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF3P09919 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3P09919 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3P09919 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3P09919 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3P09919 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3P09919 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3P09919 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3P09919 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3P09919 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3P09919 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3P09919 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3P09919 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3P09919 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3P09919 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3P09919 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3P09919 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3P09919 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3P09919 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3P09919 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3P09919 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3P09919 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3P09919 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3P09919 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3P09919 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3P09919 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3P09919 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3P09919 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3P09919 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3P09919 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3P09919 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3P09919 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3P09919 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3P09919 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3P09919 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3P09919 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3P09919 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3P09919 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3P09919 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3P09919 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3P09919 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3P09919 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3P09919 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSF3P09919 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3P09919 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3P09919 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3P09919 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3P09919 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3P09919 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3P09919 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3P09919 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3P09919 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3P09919 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3P09919 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3P09919 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3P09919 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3P09919 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3P09919 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3P09919 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3P09919 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3P09919 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3P09919 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3P09919 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3P09919 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3P09919 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3P09919 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3P09919 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3P09919 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3P09919 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF3P09919 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF3P09919 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF3P09919 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF3P09919 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF3P09919 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF3P09919 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF3P09919 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3P09919 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3P09919 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3P09919 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3P09919 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3P09919 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3P09919 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3P09919 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3P09919 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3P09919 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3P09919 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3P09919 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3P09919 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3P09919 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3P09919 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3P09919 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3P09919 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3P09919 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3P09919 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3P09919 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms