Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB5P09067 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB5P09067 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms