Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYBBP04839 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYBBP04839 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYBBP04839 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYBBP04839 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYBBP04839 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYBBP04839 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYBBP04839 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CYBBP04839 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CYBBP04839 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYBBP04839 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYBBP04839 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYBBP04839 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYBBP04839 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYBBP04839 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYBBP04839 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CYBBP04839 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYBBP04839 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYBBP04839 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYBBP04839 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CYBBP04839 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYBBP04839 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYBBP04839 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYBBP04839 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYBBP04839 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYBBP04839 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYBBP04839 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYBBP04839 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYBBP04839 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYBBP04839 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYBBP04839 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CYBBP04839 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYBBP04839 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYBBP04839 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYBBP04839 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYBBP04839 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYBBP04839 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYBBP04839 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYBBP04839 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYBBP04839 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYBBP04839 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYBBP04839 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYBBP04839 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYBBP04839 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYBBP04839 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYBBP04839 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYBBP04839 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYBBP04839 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYBBP04839 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYBBP04839 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYBBP04839 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYBBP04839 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYBBP04839 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYBBP04839 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYBBP04839 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYBBP04839 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYBBP04839 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYBBP04839 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYBBP04839 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYBBP04839 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CYBBP04839 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYBBP04839 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYBBP04839 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYBBP04839 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYBBP04839 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYBBP04839 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYBBP04839 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYBBP04839 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYBBP04839 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYBBP04839 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CYBBP04839 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYBBP04839 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYBBP04839 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYBBP04839 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYBBP04839 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYBBP04839 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYBBP04839 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYBBP04839 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYBBP04839 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBBP04839 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBBP04839 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBBP04839 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBBP04839 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBBP04839 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBBP04839 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBBP04839 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBBP04839 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBBP04839 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYBBP04839 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYBBP04839 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYBBP04839 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CYBBP04839 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYBBP04839 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYBBP04839 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYBBP04839 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBBP04839 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBBP04839 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBBP04839 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBBP04839 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBBP04839 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms