Protein–RNA interactions for Protein: P04628

WNT1, Proto-oncogene Wnt-1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT1P04628 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT1P04628 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT1P04628 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT1P04628 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WNT1P04628 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WNT1P04628 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WNT1P04628 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
WNT1P04628 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT1P04628 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT1P04628 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT1P04628 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT1P04628 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT1P04628 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT1P04628 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT1P04628 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT1P04628 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT1P04628 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT1P04628 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT1P04628 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT1P04628 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT1P04628 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT1P04628 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT1P04628 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT1P04628 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT1P04628 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT1P04628 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT1P04628 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT1P04628 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT1P04628 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT1P04628 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT1P04628 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT1P04628 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT1P04628 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT1P04628 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT1P04628 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT1P04628 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT1P04628 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT1P04628 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT1P04628 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT1P04628 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT1P04628 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT1P04628 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT1P04628 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT1P04628 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT1P04628 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT1P04628 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT1P04628 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT1P04628 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT1P04628 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT1P04628 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT1P04628 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT1P04628 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT1P04628 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT1P04628 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT1P04628 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT1P04628 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT1P04628 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT1P04628 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT1P04628 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT1P04628 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT1P04628 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT1P04628 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT1P04628 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT1P04628 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT1P04628 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT1P04628 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT1P04628 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT1P04628 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT1P04628 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT1P04628 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT1P04628 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT1P04628 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT1P04628 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT1P04628 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT1P04628 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT1P04628 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT1P04628 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT1P04628 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT1P04628 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT1P04628 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT1P04628 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT1P04628 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT1P04628 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT1P04628 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WNT1P04628 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WNT1P04628 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT1P04628 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT1P04628 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT1P04628 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT1P04628 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT1P04628 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT1P04628 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT1P04628 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT1P04628 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT1P04628 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT1P04628 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT1P04628 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT1P04628 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT1P04628 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WNT1P04628 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms