Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
A1BGP04217 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
A1BGP04217 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
A1BGP04217 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
A1BGP04217 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
A1BGP04217 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
A1BGP04217 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
A1BGP04217 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
A1BGP04217 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
A1BGP04217 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
A1BGP04217 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
A1BGP04217 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
A1BGP04217 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
A1BGP04217 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
A1BGP04217 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
A1BGP04217 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
A1BGP04217 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
A1BGP04217 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
A1BGP04217 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
A1BGP04217 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
A1BGP04217 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
A1BGP04217 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
A1BGP04217 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
A1BGP04217 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
A1BGP04217 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
A1BGP04217 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
A1BGP04217 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
A1BGP04217 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
A1BGP04217 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
A1BGP04217 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
A1BGP04217 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
A1BGP04217 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
A1BGP04217 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
A1BGP04217 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
A1BGP04217 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
A1BGP04217 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
A1BGP04217 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
A1BGP04217 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
A1BGP04217 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
A1BGP04217 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
A1BGP04217 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
A1BGP04217 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
A1BGP04217 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
A1BGP04217 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
A1BGP04217 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
A1BGP04217 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
A1BGP04217 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
A1BGP04217 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
A1BGP04217 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
A1BGP04217 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
A1BGP04217 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
A1BGP04217 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
A1BGP04217 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
A1BGP04217 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
A1BGP04217 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
A1BGP04217 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
A1BGP04217 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
A1BGP04217 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
A1BGP04217 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
A1BGP04217 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
A1BGP04217 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
A1BGP04217 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
A1BGP04217 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
A1BGP04217 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
A1BGP04217 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
A1BGP04217 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
A1BGP04217 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
A1BGP04217 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
A1BGP04217 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
A1BGP04217 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
A1BGP04217 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
A1BGP04217 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
A1BGP04217 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
A1BGP04217 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
A1BGP04217 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
A1BGP04217 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
A1BGP04217 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
A1BGP04217 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
A1BGP04217 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
A1BGP04217 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
A1BGP04217 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
A1BGP04217 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
A1BGP04217 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
A1BGP04217 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
A1BGP04217 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
A1BGP04217 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
A1BGP04217 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
A1BGP04217 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
A1BGP04217 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
A1BGP04217 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
A1BGP04217 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
A1BGP04217 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
A1BGP04217 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
A1BGP04217 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
A1BGP04217 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
A1BGP04217 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
A1BGP04217 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
A1BGP04217 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
A1BGP04217 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
A1BGP04217 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms