Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2P04141 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2P04141 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2P04141 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2P04141 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2P04141 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2P04141 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2P04141 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2P04141 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2P04141 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2P04141 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2P04141 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2P04141 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2P04141 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF2P04141 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF2P04141 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2P04141 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2P04141 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2P04141 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2P04141 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2P04141 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2P04141 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2P04141 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2P04141 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2P04141 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2P04141 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2P04141 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2P04141 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2P04141 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2P04141 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2P04141 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2P04141 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2P04141 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2P04141 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2P04141 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2P04141 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2P04141 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2P04141 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2P04141 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2P04141 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2P04141 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSF2P04141 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSF2P04141 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2P04141 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2P04141 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2P04141 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2P04141 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2P04141 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2P04141 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2P04141 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2P04141 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2P04141 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2P04141 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2P04141 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF2P04141 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2P04141 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2P04141 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2P04141 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2P04141 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2P04141 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF2P04141 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2P04141 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2P04141 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2P04141 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2P04141 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2P04141 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF2P04141 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2P04141 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2P04141 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2P04141 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2P04141 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2P04141 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2P04141 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2P04141 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2P04141 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2P04141 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2P04141 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2P04141 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2P04141 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2P04141 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2P04141 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2P04141 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2P04141 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2P04141 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2P04141 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2P04141 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2P04141 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2P04141 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2P04141 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2P04141 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2P04141 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms