Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GASTP01350 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GASTP01350 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GASTP01350 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GASTP01350 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GASTP01350 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GASTP01350 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GASTP01350 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GASTP01350 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GASTP01350 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GASTP01350 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GASTP01350 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GASTP01350 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GASTP01350 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GASTP01350 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GASTP01350 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GASTP01350 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GASTP01350 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GASTP01350 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GASTP01350 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GASTP01350 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GASTP01350 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GASTP01350 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GASTP01350 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GASTP01350 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GASTP01350 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GASTP01350 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GASTP01350 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GASTP01350 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GASTP01350 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GASTP01350 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GASTP01350 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GASTP01350 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GASTP01350 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GASTP01350 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GASTP01350 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GASTP01350 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GASTP01350 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GASTP01350 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GASTP01350 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GASTP01350 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GASTP01350 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GASTP01350 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GASTP01350 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GASTP01350 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GASTP01350 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GASTP01350 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GASTP01350 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GASTP01350 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GASTP01350 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GASTP01350 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GASTP01350 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GASTP01350 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GASTP01350 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GASTP01350 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GASTP01350 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GASTP01350 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GASTP01350 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GASTP01350 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GASTP01350 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GASTP01350 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GASTP01350 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GASTP01350 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GASTP01350 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GASTP01350 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GASTP01350 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GASTP01350 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GASTP01350 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GASTP01350 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GASTP01350 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GASTP01350 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GASTP01350 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms