Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB11O95342 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCB11O95342 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB11O95342 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB11O95342 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms