Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE8BO95263 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE8BO95263 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE8BO95263 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE8BO95263 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PDE8BO95263 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE8BO95263 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE8BO95263 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE8BO95263 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE8BO95263 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms