Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATE1O95260 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATE1O95260 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATE1O95260 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATE1O95260 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATE1O95260 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATE1O95260 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATE1O95260 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATE1O95260 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATE1O95260 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATE1O95260 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATE1O95260 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATE1O95260 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATE1O95260 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATE1O95260 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATE1O95260 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATE1O95260 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATE1O95260 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATE1O95260 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATE1O95260 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATE1O95260 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATE1O95260 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATE1O95260 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATE1O95260 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATE1O95260 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATE1O95260 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATE1O95260 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATE1O95260 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATE1O95260 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATE1O95260 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATE1O95260 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATE1O95260 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATE1O95260 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATE1O95260 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATE1O95260 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATE1O95260 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATE1O95260 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATE1O95260 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATE1O95260 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATE1O95260 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATE1O95260 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATE1O95260 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATE1O95260 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATE1O95260 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATE1O95260 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATE1O95260 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATE1O95260 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATE1O95260 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATE1O95260 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATE1O95260 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATE1O95260 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATE1O95260 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATE1O95260 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATE1O95260 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATE1O95260 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATE1O95260 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATE1O95260 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATE1O95260 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATE1O95260 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATE1O95260 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATE1O95260 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATE1O95260 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATE1O95260 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATE1O95260 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATE1O95260 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATE1O95260 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATE1O95260 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATE1O95260 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATE1O95260 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATE1O95260 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATE1O95260 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATE1O95260 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATE1O95260 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATE1O95260 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATE1O95260 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATE1O95260 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATE1O95260 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATE1O95260 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATE1O95260 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATE1O95260 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATE1O95260 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATE1O95260 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATE1O95260 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATE1O95260 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATE1O95260 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATE1O95260 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATE1O95260 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATE1O95260 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATE1O95260 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATE1O95260 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATE1O95260 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATE1O95260 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATE1O95260 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATE1O95260 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATE1O95260 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATE1O95260 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATE1O95260 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATE1O95260 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATE1O95260 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATE1O95260 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms