Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP5O95183 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP5O95183 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP5O95183 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms