Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN1O94985 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN1O94985 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN1O94985 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN1O94985 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN1O94985 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms