Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFASCO94856 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFASCO94856 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NFASCO94856 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NFASCO94856 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFASCO94856 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFASCO94856 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFASCO94856 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFASCO94856 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFASCO94856 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFASCO94856 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFASCO94856 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFASCO94856 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFASCO94856 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFASCO94856 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFASCO94856 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFASCO94856 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFASCO94856 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFASCO94856 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFASCO94856 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFASCO94856 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFASCO94856 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFASCO94856 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFASCO94856 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFASCO94856 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFASCO94856 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NFASCO94856 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFASCO94856 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFASCO94856 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFASCO94856 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFASCO94856 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFASCO94856 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFASCO94856 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFASCO94856 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFASCO94856 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFASCO94856 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFASCO94856 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFASCO94856 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFASCO94856 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFASCO94856 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFASCO94856 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFASCO94856 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFASCO94856 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFASCO94856 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFASCO94856 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NFASCO94856 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NFASCO94856 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFASCO94856 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFASCO94856 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NFASCO94856 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFASCO94856 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NFASCO94856 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFASCO94856 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NFASCO94856 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFASCO94856 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFASCO94856 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NFASCO94856 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFASCO94856 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFASCO94856 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NFASCO94856 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFASCO94856 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFASCO94856 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFASCO94856 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NFASCO94856 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFASCO94856 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFASCO94856 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFASCO94856 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFASCO94856 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NFASCO94856 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFASCO94856 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFASCO94856 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFASCO94856 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFASCO94856 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFASCO94856 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NFASCO94856 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFASCO94856 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFASCO94856 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFASCO94856 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NFASCO94856 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFASCO94856 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFASCO94856 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFASCO94856 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFASCO94856 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFASCO94856 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFASCO94856 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFASCO94856 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFASCO94856 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFASCO94856 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NFASCO94856 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFASCO94856 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFASCO94856 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NFASCO94856 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFASCO94856 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFASCO94856 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFASCO94856 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFASCO94856 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFASCO94856 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFASCO94856 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFASCO94856 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFASCO94856 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms