Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG12O94817 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG12O94817 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG12O94817 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG12O94817 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG12O94817 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG12O94817 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG12O94817 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG12O94817 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG12O94817 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG12O94817 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG12O94817 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG12O94817 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG12O94817 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG12O94817 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG12O94817 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG12O94817 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG12O94817 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG12O94817 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG12O94817 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG12O94817 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG12O94817 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG12O94817 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG12O94817 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG12O94817 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG12O94817 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG12O94817 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG12O94817 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG12O94817 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG12O94817 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG12O94817 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG12O94817 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG12O94817 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG12O94817 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG12O94817 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG12O94817 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG12O94817 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG12O94817 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG12O94817 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG12O94817 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG12O94817 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG12O94817 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG12O94817 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG12O94817 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG12O94817 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG12O94817 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG12O94817 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG12O94817 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG12O94817 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG12O94817 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG12O94817 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG12O94817 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG12O94817 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG12O94817 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG12O94817 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG12O94817 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG12O94817 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG12O94817 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG12O94817 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG12O94817 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG12O94817 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG12O94817 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG12O94817 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG12O94817 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG12O94817 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG12O94817 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG12O94817 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG12O94817 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG12O94817 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG12O94817 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG12O94817 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms