Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1BO75688 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1BO75688 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1BO75688 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1BO75688 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms