Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC4O75487 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC4O75487 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC4O75487 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC4O75487 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC4O75487 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC4O75487 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC4O75487 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC4O75487 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC4O75487 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC4O75487 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC4O75487 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC4O75487 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC4O75487 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC4O75487 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC4O75487 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC4O75487 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC4O75487 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC4O75487 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC4O75487 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC4O75487 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC4O75487 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC4O75487 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC4O75487 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC4O75487 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC4O75487 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC4O75487 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC4O75487 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC4O75487 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC4O75487 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC4O75487 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC4O75487 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC4O75487 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC4O75487 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC4O75487 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC4O75487 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC4O75487 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC4O75487 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC4O75487 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC4O75487 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC4O75487 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC4O75487 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC4O75487 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC4O75487 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC4O75487 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC4O75487 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC4O75487 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC4O75487 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC4O75487 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC4O75487 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC4O75487 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC4O75487 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC4O75487 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC4O75487 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC4O75487 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC4O75487 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC4O75487 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC4O75487 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC4O75487 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC4O75487 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC4O75487 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC4O75487 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC4O75487 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC4O75487 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC4O75487 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC4O75487 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC4O75487 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC4O75487 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC4O75487 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC4O75487 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC4O75487 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC4O75487 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC4O75487 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC4O75487 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC4O75487 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC4O75487 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC4O75487 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC4O75487 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC4O75487 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC4O75487 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms