Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIPSNAP2O75323 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPSNAP2O75323 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPSNAP2O75323 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms