Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOL3O60936 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOL3O60936 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOL3O60936 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOL3O60936 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOL3O60936 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOL3O60936 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOL3O60936 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOL3O60936 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOL3O60936 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOL3O60936 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOL3O60936 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOL3O60936 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOL3O60936 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOL3O60936 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOL3O60936 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOL3O60936 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOL3O60936 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOL3O60936 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOL3O60936 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOL3O60936 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOL3O60936 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOL3O60936 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOL3O60936 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOL3O60936 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOL3O60936 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NOL3O60936 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOL3O60936 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOL3O60936 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NOL3O60936 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NOL3O60936 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOL3O60936 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOL3O60936 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOL3O60936 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOL3O60936 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NOL3O60936 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOL3O60936 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOL3O60936 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOL3O60936 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOL3O60936 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOL3O60936 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOL3O60936 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOL3O60936 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOL3O60936 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOL3O60936 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOL3O60936 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOL3O60936 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOL3O60936 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOL3O60936 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOL3O60936 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOL3O60936 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOL3O60936 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOL3O60936 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOL3O60936 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOL3O60936 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOL3O60936 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOL3O60936 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOL3O60936 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOL3O60936 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOL3O60936 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOL3O60936 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOL3O60936 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOL3O60936 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOL3O60936 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOL3O60936 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOL3O60936 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOL3O60936 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOL3O60936 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOL3O60936 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOL3O60936 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOL3O60936 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOL3O60936 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOL3O60936 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOL3O60936 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOL3O60936 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOL3O60936 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOL3O60936 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOL3O60936 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOL3O60936 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOL3O60936 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOL3O60936 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOL3O60936 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOL3O60936 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOL3O60936 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOL3O60936 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOL3O60936 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOL3O60936 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOL3O60936 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOL3O60936 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOL3O60936 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOL3O60936 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOL3O60936 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOL3O60936 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NOL3O60936 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOL3O60936 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOL3O60936 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOL3O60936 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOL3O60936 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOL3O60936 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOL3O60936 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms