Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR5O60602 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR5O60602 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR5O60602 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR5O60602 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR5O60602 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR5O60602 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR5O60602 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR5O60602 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR5O60602 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR5O60602 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR5O60602 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR5O60602 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR5O60602 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR5O60602 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR5O60602 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR5O60602 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR5O60602 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR5O60602 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR5O60602 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR5O60602 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR5O60602 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR5O60602 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR5O60602 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR5O60602 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR5O60602 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR5O60602 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR5O60602 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR5O60602 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR5O60602 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR5O60602 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR5O60602 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR5O60602 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR5O60602 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR5O60602 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR5O60602 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR5O60602 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR5O60602 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR5O60602 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR5O60602 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TLR5O60602 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TLR5O60602 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TLR5O60602 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TLR5O60602 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TLR5O60602 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR5O60602 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR5O60602 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR5O60602 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR5O60602 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR5O60602 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR5O60602 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR5O60602 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR5O60602 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR5O60602 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR5O60602 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR5O60602 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR5O60602 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR5O60602 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR5O60602 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR5O60602 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR5O60602 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR5O60602 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR5O60602 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR5O60602 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR5O60602 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR5O60602 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR5O60602 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR5O60602 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR5O60602 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR5O60602 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR5O60602 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR5O60602 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR5O60602 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TLR5O60602 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TLR5O60602 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TLR5O60602 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TLR5O60602 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TLR5O60602 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TLR5O60602 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TLR5O60602 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TLR5O60602 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TLR5O60602 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TLR5O60602 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR5O60602 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR5O60602 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR5O60602 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR5O60602 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR5O60602 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR5O60602 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR5O60602 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TLR5O60602 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms