Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2AO43736 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2AO43736 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITM2AO43736 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms