Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRS3O43559 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRS3O43559 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRS3O43559 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FRS3O43559 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRS3O43559 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRS3O43559 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRS3O43559 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FRS3O43559 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FRS3O43559 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRS3O43559 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRS3O43559 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRS3O43559 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRS3O43559 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRS3O43559 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRS3O43559 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRS3O43559 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRS3O43559 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FRS3O43559 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRS3O43559 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRS3O43559 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRS3O43559 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRS3O43559 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FRS3O43559 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRS3O43559 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRS3O43559 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRS3O43559 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRS3O43559 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRS3O43559 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRS3O43559 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRS3O43559 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRS3O43559 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRS3O43559 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRS3O43559 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FRS3O43559 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRS3O43559 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRS3O43559 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRS3O43559 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRS3O43559 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRS3O43559 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRS3O43559 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRS3O43559 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRS3O43559 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRS3O43559 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRS3O43559 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRS3O43559 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRS3O43559 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRS3O43559 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRS3O43559 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRS3O43559 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRS3O43559 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRS3O43559 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRS3O43559 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRS3O43559 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRS3O43559 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRS3O43559 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRS3O43559 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRS3O43559 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRS3O43559 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FRS3O43559 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRS3O43559 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FRS3O43559 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FRS3O43559 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRS3O43559 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRS3O43559 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRS3O43559 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRS3O43559 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRS3O43559 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRS3O43559 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRS3O43559 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRS3O43559 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRS3O43559 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRS3O43559 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRS3O43559 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRS3O43559 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRS3O43559 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRS3O43559 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRS3O43559 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRS3O43559 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRS3O43559 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRS3O43559 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRS3O43559 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FRS3O43559 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRS3O43559 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRS3O43559 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRS3O43559 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRS3O43559 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRS3O43559 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRS3O43559 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRS3O43559 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms